組培室建設應該考慮想要生產的品種，這點大家往往并不是很重視。很多人以為建設一個組培室，將來是可以生產很多甚至是所有的任何植物品種。這是最常見的誤區。其實不同植物的品種其組培特性也是不同的，培養周期是不同的，培養條件也是不同的。不根據品種特性而盲目的設計會對將來的空間利用、生產效率、環境控制以及生產成本等造成難以估量的影響。其次還要考慮生產的目的，是快速擴繁?還是種苗脫毒?是銷售瓶苗、半成苗還是銷售成苗?這些都需要在設計階段充分考慮，不同的目的對于組培工廠的布局設計也是不同的。再者就是產能，結合品種、市場、自身條件設定目標產能，根據產能最終確定組培工廠的規模。